Das Deutsche Schiffahrtsmuseum ist eines der acht kunst- und kulturwissenschaftlichen und naturkundlichen  Forschungsmuseen der Leibniz-Gemeinschaft – neben dem Deutschen Bergbau-Museum in Bochum, dem Deutschen Museum in München, dem Germanischen Nationalmuseum in Nürnberg, dem Museum für Naturkunde in Berlin, dem Römisch-Germanischen Zentralmuseum in Mainz, der Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung in Frankfurt am Main und dem Zoologischen Forschungsmuseum Alexander Koenig in Bonn. »Die Forschungsmuseen spiegeln einen wichtigen Aspekt der Leibniz-Gemeinschaft wider, nämlich die fachübergreifende Forschung an Themen von nationaler und internationaler Bedeutung sowie die Vermittlung der Forschungsergebnisse an die Öffentlichkeit.« (s. unter www.leibniz-gemeinschaft.de)

Die Wissenschaftsgemeinschaft Gottfried Wilhelm Leibniz e.V., kurz "Leibniz-Gemeinschaft", wurde nach dem Philosophen, Mathematiker, Physiker und Historiker Gottfried Wilhelm Leibniz (1646 - 1716) benannt. Sie „ist ein Zusammenschluss von 87 Forschungseinrichtungen, die wissenschaftliche Fragestellungen von gesamtgesellschaftlicher Bedeutung bearbeiten. Sie stellen Infrastruktur für Wissenschaft und Forschung bereit und erbringen forschungsbasierte Dienstleistungen – Vermittlung, Beratung, Transfer - für Öffentlichkeit, Politik, Wissenschaft und Wirtschaft. Sie forschen auf den Gebieten der Natur-, Ingenieur- und Umweltwissenschaften über die Wirtschafts-, Sozial- und Raumwissenschaften bis hin zu den Geisteswissenschaften.

Die Leibniz-Gemeinschaft zeichnet sich durch die große Vielfalt der in den Instituten bearbeiteten Themen ebenso wie durch ihre dezentrale Organisationsform aus: Ihre Einrichtungen sind in den meisten Fällen wissenschaftlich und organisatorisch unabhängig. Sie betreiben strategische, themenorientierte Forschung. Ihr Anspruch orientiert sich immer an wissenschaftlicher Exzellenz sowie gesellschaftlicher Relevanz.“